MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Crinalium epipsammum PCC 9333 plasmid pCRI9333.06

Total Repeats: 162

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019755	GGT	2	6	30	35	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019755	TTAT	2	8	864	871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019755	TAG	2	6	872	877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019755	A	6	6	954	959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019755	ATTTG	2	10	1239	1248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019755	TGA	2	6	1402	1407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019755	CTGT	2	8	1420	1427	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_019755	AAG	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019755	ATG	2	6	1509	1514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019755	T	6	6	1525	1530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019755	CTTT	2	8	1552	1559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_019755	TAC	2	6	1634	1639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019755	CT	3	6	1716	1721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_019755	GTGCT	2	10	1732	1741	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_019755	TTA	2	6	1762	1767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019755	GC	3	6	1843	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_019755	TTA	2	6	5954	5959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_019755	ATG	2	6	5964	5969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019755	T	8	8	6883	6890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019755	TCA	2	6	6925	6930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_019755	T	7	7	6972	6978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019755	T	7	7	7031	7037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019755	T	6	6	7043	7048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019755	T	7	7	7052	7058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019755	ATT	2	6	7167	7172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019755	TGT	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019755	TAT	2	6	8315	8320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019755	ACA	2	6	8326	8331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019755	TGA	2	6	8337	8342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019755	A	6	6	8358	8363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019755	GTTT	2	8	8432	8439	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019755	TGCCT	2	10	8476	8485	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_019755	GCCTT	2	10	8565	8574	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_019755	CCTTAC	2	12	8631	8642	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_019755	TGA	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019755	T	6	6	8743	8748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019755	T	6	6	8751	8756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019755	TCT	2	6	8822	8827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_019755	TGG	2	6	8931	8936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019755	T	8	8	9716	9723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019755	T	6	6	9726	9731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_019755	TAC	2	6	9764	9769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019755	AT	3	6	9773	9778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019755	TAAAG	2	10	9791	9800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019755	T	6	6	10098	10103	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019755	ATT	2	6	10113	10118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019755	ATTAC	2	10	10126	10135	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_019755	TTC	2	6	10279	10284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_019755	TTA	2	6	10318	10323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019755	ATT	2	6	10340	10345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019755	A	7	7	10351	10357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_019755	TTTAA	2	10	10383	10392	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019755	CAA	2	6	10398	10403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_019755	ATT	2	6	10976	10981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_019755	CAAG	2	8	11103	11110	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_019755	AAT	2	6	11111	11116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019755	ATA	2	6	11301	11306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019755	TAC	2	6	11355	11360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019755	TTGA	2	8	11381	11388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019755	TTG	2	6	12155	12160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019755	TTG	2	6	12245	12250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019755	ATC	2	6	12279	12284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_019755	AGA	2	6	12388	12393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019755	AAT	2	6	12516	12521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019755	AGT	2	6	12605	12610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019755	CACTT	2	10	12794	12803	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_019755	ACT	2	6	12887	12892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_019755	ATC	2	6	12951	12956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019755	CTC	2	6	12958	12963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_019755	ACC	2	6	12965	12970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_019755	GTA	2	6	13041	13046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019755	TAA	2	6	13093	13098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019755	ACG	2	6	13139	13144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_019755	TAA	2	6	13238	13243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019755	TC	3	6	13273	13278	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_019755	GTT	2	6	13387	13392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_019755	GATT	2	8	13396	13403	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019755	ATA	2	6	13461	13466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019755	TGT	3	9	13524	13532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019755	GTA	2	6	13580	13585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019755	CTA	2	6	13651	13656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_019755	TTTC	2	8	13765	13772	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_019755	ATA	2	6	13820	13825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019755	T	7	7	13847	13853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019755	ATT	2	6	13892	13897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019755	ATC	2	6	13932	13937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_019755	TGGC	2	8	13947	13954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_019755	CTA	2	6	14020	14025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_019755	TAC	2	6	14048	14053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019755	AAATA	2	10	14114	14123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019755	CTT	2	6	14140	14145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_019755	TTG	2	6	14166	14171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019755	TAA	2	6	14203	14208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_019755	TGT	2	6	14301	14306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019755	CAAA	2	8	14377	14384	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_019755	AAG	2	6	14437	14442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019755	T	7	7	14515	14521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019755	AAG	2	6	14577	14582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019755	CTC	2	6	14799	14804	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_019755	AAC	2	6	14836	14841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_019755	GAT	2	6	14858	14863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019755	AT	3	6	14899	14904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019755	TGA	2	6	14926	14931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019755	TAA	2	6	15004	15009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019755	TCT	2	6	15042	15047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019755	CATT	2	8	15121	15128	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_019755	GTT	2	6	15178	15183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019755	T	6	6	15218	15223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019755	GACA	2	8	15238	15245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019755	TTG	2	6	15266	15271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019755	TGG	2	6	15279	15284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019755	ACT	2	6	15336	15341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_019755	AT	3	6	15389	15394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019755	TTG	2	6	15399	15404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019755	A	6	6	15451	15456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019755	CTA	2	6	16244	16249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_019755	CG	3	6	16323	16328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_019755	A	6	6	16365	16370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019755	GGAA	2	8	19696	19703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_019755	CAG	2	6	19768	19773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_019755	GAA	2	6	19816	19821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019755	GTG	2	6	19866	19871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019755	TAAGT	2	10	21051	21060	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019755	AT	3	6	21145	21150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019755	AGA	2	6	21161	21166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019755	AAG	2	6	24532	24537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019755	AAATT	2	10	24569	24578	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_019755	GAAA	2	8	24620	24627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019755	GCT	2	6	24709	24714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_019755	TTC	2	6	24715	24720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_019755	TCA	2	6	24790	24795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_019755	CAG	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_019755	TAC	2	6	24855	24860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_019755	TAC	2	6	24869	24874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019755	CACC	2	8	24911	24918	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_019755	TTA	2	6	25038	25043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019755	TTA	2	6	25075	25080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_019755	GATA	2	8	25086	25093	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_019755	CTA	2	6	26161	26166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_019755	TTAA	2	8	26247	26254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019755	TTG	2	6	26276	26281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019755	TAG	2	6	26333	26338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019755	TAA	2	6	26471	26476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019755	ATT	2	6	26630	26635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019755	GCA	2	6	26636	26641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_019755	A	6	6	26670	26675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_019755	ATC	2	6	28720	28725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_019755	AG	3	6	28793	28798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019755	T	6	6	28833	28838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_019755	A	7	7	28896	28902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019755	A	6	6	28907	28912	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019755	ATTT	2	8	28965	28972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019755	T	6	6	28970	28975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019755	ATAA	2	8	29002	29009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019755	CTG	2	6	29120	29125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_019755	TTA	2	6	29139	29144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019755	ACT	2	6	29159	29164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_019755	TTA	2	6	29363	29368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019755	A	6	6	29417	29422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_019755	ATTG	2	8	29442	29449	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019755	AGAGCG	2	12	29464	29475	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_019755	GTT	2	6	29483	29488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.